Page 14 - 01-44_nagy.pdf

TUDÓS CSAJOK $ URYDWRW D 1HP]HWL 7HKHWVËJ 3URJUDP D] (PEHUL (U×IRUUÃVRN
0LQLV]WËULXPD ËV D] (PEHUL (U×IRUUÃV 7ÃPRJDWÃVNH]HO× WÃPRJDWMD

0LW FVLQžO HJ\

V]XSHUEDNW¦ULXP"

ARI ESZTER 2016 ÓTA TAGJA PAPP BALÁZS KUTATÓCSOPORTJÁNAK
AZ AKADÉMIA SZEGEDI BIOLÓGIAI KUTATÓKÖZPONTJÁBAN.
BIOINFORMATIKUSKÉNT KUTATÓTÁRSAIVAL ARRA KERESI
A VÁLASZT, HOGYAN ALAKULNAK KI A SZUPERBAKTÉRIUMOK.
DE MI AZ A SZUPERBAKTÉRIUM, ÉS MIT CSINÁL EGY BIOINFORMATIKUS?
A TUDÓS CSAJOK ROVATÁBÓL MOST KIDERÜL.

MILYEN PROJEKTEN baktériumok válhatnak szuperbaktériummá,
DOLGOZOL JELENLEG? nem csak miután megbetegítettek valakit.
A mostani kutatás arról szól, hogy az Javaslatokat is lehet tenni, hogy milyen
antibiotikum rezisztencia gének és antibiotikum lenne hatásos ellenük.
a virulenciát okozó faktorok (amik a A másik cél, hogy felmérjük a helyzetet,
baktériumokban előidézik, hogy meg tudják mert ezidáig nem készült átfogó vizsgálat
betegíteni az embert), hogyan terjednek ebben a témában. Ezt a géncsere hálózatot
a különböző baktériumok között. Ezt én más kutatók is használhatják a jövőben,
bioinformatikai szemszögből fogom vizsgálni például antibiotikum tervezéshez.
több ezer bakteriális genom (örökítő
anyag) feldolgozásával. A kollégáim pedig MIVEL TELIK EGY olyan szoftvereket használ, amit egérrel
a laborban fogják mérni a rezisztencia HÉTKÖZNAPOD kell nyomkodni. Így jött, hogy jó lenne
és virulencia gének terjedését különböző A MUNKÁD SORÁN? programozni meg parancssorban dolgozni,
módszerekkel, például infekciós modelleken, Áprilisban kezdtem el ismét dolgozni, mert amit már igazából lehet bioinformatikának
vagyis egereken, rovarok lárváján. szülési szabadságon voltam. Előtte az ELTE-n is nevezni. A továbbiakban pedig a
dolgoztam oktatóként, bioinformatikát bioinformatikához kapcsolódó kurzusokon
MI A SZEREPE tanítottam, és mellette otthonról vagy az vettem részt itthon és külföldön.
BIOINFORMATIKÁNAK irodámból végeztem ezeket az elemzéseket,
A KUTATÁSBAN? programozásokat, mivel nem kell hozzá MIÉRT TARTOD FONTOSNAK
Főként adatelemzés. Mivel már több tízezer labor. Most jellemzően otthonról dolgozom. A BIOINFORMATIKÁT?
baktériumnak a genetikai anyaga elérhető A biológiában átálltak arra, hogy rengeteg
online, inkább ezen adatok feldolgozására HOGY KÖTÖTTÉL KI adatot generáljanak. Magyarországon még
koncentrálok. Ki fogom számolni a A BIOINFORMATIKA MELLETT? nem terjedt el nagyon, de Nyugat-Európában
baktérium fajok és génjeik evolúciós MI VONZOTT BENNE? és az Egyesült Államokban szokás, hogy
távolságát, hogy meg tudjam határozni Amikor egyetemista voltam, nemigen létezett megszekvenálják a kórházba érkező betegek
a baktériumok közt átadott géneket. még a bioinformatika. A biológián belül saját genomját, vagy annak a kórokozónak
először a fajok sokfélesége és ezek rendszere, a genomját, ami megbetegítette őket; és
MI A CÉLJA? vagyis az állatrendszertan vonzott. Tetszett, mindez több gigabájt adatot eredményez,
A távlati cél, hogy rá tudjunk mutatni hogy rendszerezi az ismereteinket. Ehhez a amit fel kell dolgoznia valakiknek,
olyan baktériumokra, amelyek potenciális rendszerbe foglaláshoz akkoriban kezdett amire van egy rutinszerű eljárás, ennek
szuperbaktériumok, vagyis, hogy patogének elterjedni, hogy a DNS alapján számítják kidolgozásához például bioinformatikusok
(megbetegítésre képesek), és mellette ki a különböző élőlények rokonsági kellenek. De ez a kutatásban nem ilyen
multidrog rezisztensek, vagyis olyan viszonyait, tehát törzsfákat hoznak létre. egyszerű, minden feladat más-más megoldást
baktériumok, amikre többféle antibiotikum Ebben a témában kezdtem el szakdolgozni, igényel. Úgyhogy egyre nagyobb kereslet
sem hat. Ezeket a genomokat vizsgálva majd PhD-zni, és ehhez elengedhetetlenül mutatkozik a bioinformatikusok iránt.
előre meg lehet mondani, hogy mely kapcsolódott, hogy az ember nem csak (Bihari Bernadett Luca)
14